La División de Producción y Protección Vegetal (AGP) considera la reducción de la dependencia de los plaguicidas un elemento principal de sus áreas centrales relacionadas con la intensificación de la producción sostenible y la reducción de riesgos de los plaguicidas. Los programas de manejo integrado de plagas (MIP) han demostrado que, a menudo, se puede reducir considerablemente el uso de plaguicidas sin que disminuyan el rendimiento ni los beneficios de los agricultores.

La prevención de la extensión de plagas salva cultivos y reduce la necesidad de utilizar plaguicidas. Mediante la Convención Internacional de Protección Fitosanitaria y el programa de sanidad vegetal del EMPRES, AGP ayuda a prevenir la extensión de plagas y enfermedades vegetales. El programa de sanidad vegetal del EMPRES comprende los programas sobre plagas migratorias y la roya del tallo del trigo.