La FAO est installée au Bénin depuis le 29 décembre 1977 (date d’accord d’établissement de la Représentation), l’ouverture effective du bureau date d’août 1978.

L’importance des activités de la FAO au Bénin peut être subdivisée en deux périodes, à savoir la période d’avant 2000 et la période d’après. La période d’avant 2000 a été celle où le rôle de la FAO en tant qu’agence d’exécution a été fortement marquée, elle a connu l’élaboration et la mise en œuvre de plusieurs projets sous la responsabilité directe de la FAO, avec la contribution financière des bailleurs de fonds dont principalement le PNUD, la Banque Mondiale, le FENU, la BAD et le FIDA.

Ces projets ont porté entre autres sur le développement rural intégré de certaines régions, la diversification agricole, le développement des systèmes d’élevage, le développement des systèmes de stockage décentralisés, le développement de la pêche artisanale, la promotion de l’irrigation privée, les inventaires, études et aménagement des bas-fonds, la promotion de la culture attelée et de l’artisanat rural.

La période d’après 2000 où l’Organisation s’est affirmée dans le pays à travers un programme identitaire spécifique à savoir le PSSA et ses différentes évolutions et les programmes de coopération technique essentiellement basés sur le transfert de connaissances.

Aujourd’hui, la FAO est la plus grande institution spécialisée du Système des Nations Unies, chef de file dans les domaines de l’agriculture, des forêts, des pêches et du développement rural. L’Organisation privilégie la promotion du développement rural et de l’agriculture durable, stratégie d’amélioration à long terme de la production vivrière et de la sécurité alimentaire permettant de conserver et de gérer les ressources naturelles.