La sauvagine et les oiseaux de rivage sont considérés comme des réservoirs naturels de tous les sous-types viraux de la grippe aviaire dont la plupart n’ont peu ou pas d’effets pathogènes sur la faune sauvage. Le virus grippal de type A a toutefois subi un ensemble de dérives et de réassortiments génétiques qui ont abouti à la souche H5N1 responsable d’infections, létales ou non, chez de nombreuses espèces sauvages. Bien qu’un certain degré de surveillance soit désormais exercé, des recherches complémentaires s’imposent afin de déterminer le rôle des oiseaux sauvages dans le portage sain et l’excrétion des virus de la grippe aviaire.

Ce manuel donne des indications de base pour la surveillance de la faune sauvage et les enquêtes sur les cas infectieux, quelle qu’en soit la cause. Ses chapitres traitent des signes cliniques des maladies infectieuses, de la manipulation des oiseaux et des techniques de prélèvement d’échantillons, de la manipulation et du transport des échantillons, quelle que soit la cause de morbidité présumée, et des techniques de diagnostic. Il comporte également des recommandations importantes sur la désinfection et la protection personnelle.

Table des matières





Remerciements

Introduction

CHAPITRE 1
Signes cliniques de maladie infectieuse

CHAPITRE 2
Manipulation des oiseaux vivants

Prélèvement d'échantillons sanguins
Euthanasie

CHAPITRE 3
Collecte d’oiseaux morts

Stratégie d’échantillonnage pour la grippe aviaire

CHAPITRE 4
Protocole d’autopsie aviaire

Hygiène et sécurité du travail en situation d’autopsie
Protocole d’autopsie aviaire
Examen externe
Examen interne

CHAPITRE 5
Collecte de prélèvements autopsiques

CHAPITRE 6
Prélèvement d’échantillons

Échantillons à prélever durant l’autopsie

CHAPITRE 7
Techniques d’écouvillonnage

Procédure pour le prélèvement d’échantillons

CHAPITRE 8
Manipulation et transport des échantillons

Écouvillonnages et milieux de transport viral
Sérum, plasma et tissus frais
Tissus fixés au formol
Expédition des échantillons

CHAPITRE 9
Diagnostics

Diagnostic du virus H5N1 de la grippe aviaire par le laboratoire
Tests de diagnostic rapide
RT-PCR

CHAPITRE 10
Élimination des carcasses

Sur le terrain

CHAPITRE 11
Désinfection

CHAPITRE 12
Protection personnelle

Annexes

1. Fiche de collecte d’échantillons d’oiseaux malades ou morts
2. Réseau OIE/FAO (OFFLU) et laboratoires de référence pour la grippe aviaire
3. Illustrations de pathologie clinique

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