يهتم قسم الصناعات السمكية بتطوير تكنولوجيا مصايد الأسماك والمعلومات ووضع السياسات والاستراتيجيات لأعضاء المنظمة. وهو يقدم المشورات والمساعدات لأعضاء المنظمة ولصناعة مصايد الأسماك على كافة المستويات، وبشأن الاستخدام الأمثل لمواردها السمكية البحرية وفي المياه العذبة من أجل الاستهلاك البشري المباشر والاستخدامات أخرى. ويهتم القسم بنقل وتكييف الأساليب التقنية والتكنولوجيات الملائمة في مجالات الصيد ومداولة المصيد ومعالجته وتوزيع الأسماك والمنتجات السمكية وتسويقها ونشر المعلومات ذات الصلة بهذه الموضوعات. ويشمل قسم الصناعات السمكية مكتب مدير القسم وإدارتين متخصصتين.