在天然贝苗供应充足且可靠的地方，牡蛎养殖者在野生环境安装采集器，确保各自的苗种供应，而不依赖育苗场。全球贝苗供应的大部分为野生采集的苗种，采集方法包括在长线和浮筏上吊挂的各种固着材料。然而，其它商业化养殖单位则经营育苗场，现介绍如下：

亲体

育苗场采用的亲体通常来自商业养殖单位私营的海水养成设施，而且取自最佳条件下养殖的精选种群。鉴于成贝的性别无法确定，因此需要从冬季一直到自然产卵季节定期采集成贝群。将它们单独放入流水式水槽中暂养，在所使用的海水补充了养殖海藻，水温在20–22 °C，盐度保持在25–32‰范围内。在冬季月份中，如果成贝性发育低下，配子的初步形成和成熟需要大约六周的孵化培育。随着产卵季节临近和自然海水温度上升，所需的时间逐渐缩短。含有成熟配子的成贝可以采用热冲击方法产卵，但是最常见的是将它们打开，采用巴氏吸管使配子从性腺“脱离”，这是一个能确保取得良好结果的程序。活重为70–100 g的成熟雌贝将能生产超过5 000–8 000万枚卵。出于生产目的，通过从相同数量雄贝采集的少量精液样本使六个或更多雌贝所产的卵受精。从受精卵发育成带壳的前双壳Ⅰ期（D形幼虫）阶段都是在大容量水槽中进行，水槽中灌注的海水经过严格过滤，而且往往经过紫外线处理，水温为25–28 °C，盐度在25–32‰之间。在早期发育阶段，水槽不充气，不添加食物，持续时间大约24小时。全球大部分育苗场目前均将三倍体的生产作为重点。倍性操作（通常采用温度冲击）通常在受精后不久进行，尽管最新的趋势是将四倍体与二倍体杂交，这样可确保获得100%的三倍体后代。

幼虫和后期幼虫养殖

幼虫可在静水或流水水槽系统中生长至浮游面盘幼虫期，在25–28 °C水温条件下这一阶段可持续14-18天。最佳盐度在20-25‰之间。最初的养殖密度大约为20 000个D形幼虫/升，而随着发育而出现自然死亡和换水时进行筛选分级，这一密度降至5 000个/升。在静水水槽系统中，选择性分级每周进行3次或4次。其目的是随着附着和变态阶段的临近，只保留生长较快、更健康的幼虫。幼虫的饲料是养殖藻类。早期面盘幼虫（壳长<120 µm）每日采用定量的等鞭金藻（Isochrysis galbana ）或巴夫藻（ Pavlova lutherii ），加上诸如钙质角毛藻（Chaetoceros calcitrans ）或海链藻（Thalassiosira pseudonana ）的小矽藻进行投喂。后期幼虫的饲料包括相同种类并辅以一种或多种较大型绿色鞭毛藻（Tetraselmis ）。当幼虫准备附着时便开始出现有色“眼点”，可以通过透明壳瓣清楚地看到。在此阶段还生出一只足。此时将附着基质放入水槽，供幼虫寻找并附着。可以使用略微粗糙的黑色PVC薄膜、有凹槽的PVC管子、贝壳或壳屑等作为附着基的表面材料。另一种方法是将成熟幼虫装好并运到牡蛎养殖者那里自行附着并养至上市规格。这些地点往往远离育苗场。这后一种做法是北美太平洋沿岸选用的方法，该过程被称为远距离附着。

在世界许多其他地方，在育苗场附着和生长的幼贝（稚贝）在育苗设施严格管理的条件下长到几毫米（3–5 mm之间）。该生产阶段通常是在大型水槽系统中完成的，每天进行部分换水，在这一系统中幼贝作为流动层被暂养于培养容器中，该过程被称为上升流养殖。不断投喂来自育苗场养殖的，或来自附近室外水槽或池塘中繁殖的高营养价值藻类促进了稚贝的迅速生长。一旦达到所需的规格，稚贝便被运往育苗场自己的室外育苗系统或包装并出售给牡蛎养殖者。

育苗场频繁开展海上或陆上中间培育场养殖作业，在那里贝苗从1 mm长至15 mm。在高产地区，密度可以达到100 kg/m³ 水流。采用这种方法来降低小贝苗的死亡率，因为如果直接将贝苗转入海水养成，小贝苗就有可能死亡。海上中间培育场一般采用上升流系统，安装在驳船或筏子上，处于较温暖和生产力更强的河口环境。这种防护设施最大限度地减少了因捕食行为造成的损失。上升流方法还被广泛用于陆基中间培育场，可以将设备安装在咸水塘中的驳船上，或安装在陆上水槽系统中并使用从池塘中抽取的含有丰富藻类的水。池塘或许具有自身生产力或采用人工或天然肥料进行强化。就异地附着而言，稚贝附着在袋装的贝壳附着基、成串贝壳或塑料材料上，供幼虫附着的水槽也被用来进行数天或更长时间的稚贝暂养。在某种保护性养殖中（或潮间采用网眼或帆布罩，或潮线下采用筏子或吊养），上述工作是在放置附着基之前进行的，其目的是尽可能减少捕食损失。野生环境采集的稚贝采用类似处理方法。

在使用施肥池塘供水的上升流中间培育场中，用于养成的10–15 mm苗种的产量可以达到3吨/公顷。

养成阶段几乎全部在海水中完成。根据不同的环境（如潮汐带、掩蔽处、租赁水域的水深、海湾和河口的水交换率、基质的种类等）和传统，所使用的方法很多，包括水底、离底和垂下式养殖。

水温在15–25 °C以及盐度在25和32之间时生长率较快。天然浮游植物饲料供应的补充率是关键。长巨牡蛎需要18-30个月达到70–100 g活重（带壳）的上市规格。面积覆盖数千公顷广泛水域被用来开展包括种苗采集在内的养成阶段的所有活动，育苗和生长阶段，以及收获前牡蛎的硬化，该水域的产量可以达到25吨/公顷/年。如果是宽阔、独立的小面积租赁水域，产量可以大大提高（>70吨/公顷/年）。

水底养殖

可将苗种播撒在事先用贝壳或石子铺垫的较为坚实的潮间或潮下地面上，贝苗（1-2 g活重）密度为200–400个/m²，采用防掠食者的保护设备（围栏或网罩）。还可以在无防护装置的情况下采用~200/m²的密度播撒贝苗（10 g活重）。其目的是将播苗密度控制在适当水平，使牡蛎在达到上市规格之前无需进一步的管理。

离底养殖

选择较低的潮间带适宜的地面，将贝苗装在网袋或不同类型的多孔塑料盘中，用绳索或橡皮圈固定在木框或钢筋支架上。这种系统有时位于潮下带，但是这会增加操作费用。离底养殖可被用于育苗的中间阶段或作为将产品养至上市规格的一个方法。10–15 mm贝苗的播苗密度可为基地的每0.25 或 0.5 m²的托盘为1000–2000个，需要定期维护和维修，将牡蛎以较低的密度转移到干净的袋子/托盘，其网孔大小随牡蛎的成长而增加。在生产力比较高的地区，一旦牡蛎生物量超过5 kg/m²托盘区时，生长速度明显减慢。

垂下式养殖

吊漂养殖采用长线（最常见的）或浮筏悬吊的立体装置。这些装置可以是贝壳绳索或网线，供贝苗附着；它们也可以是一系列网子、网袋或塑料托盘，每袋或每盘的养殖密度与离底养殖方式相同。在沉放养殖装置时，应注意选择污损生物较少的地点，而且在浅水区应避免接触水底。定期维护和维修是必要的，目的是将处于生长期的牡蛎以较低的密度转移到干净的袋子/托盘，其网孔大小随牡蛎成长而增加。

漂浮式养殖

某些地区在贝苗生长的早期阶段使用带有网孔基座的木框托盘或带有漂浮环圈的多孔（聚苯乙烯泡沫）塑料托盘。上述装置的顶部需要使用帆布或密实的网状物覆盖以避光。

硬化

在垂下式养殖系统中生长的长巨牡蛎在收获前通常需要3-4个月的“硬化”期。硬化过程允许每天几次接触空气，通常发生在潮间带或潮夕带的浅水区。接触空气的牡蛎有着更高的含肉量，而且收获后的保质效果更好。

牡蛎通常在壳长达到>75 mm，活重在70–100+ g时便可收获。水底养殖的收获方式用手耙或手捡或在潮间带河床处于水下时用挖掘器挖捕。离底或盘式养殖或延绳垂下式养殖的牡蛎使用小型渔船或机动驳船进行采收，如果产品是供应半壳产品贸易的，这些船只通常配备机械清洗和分级器。每年某些时间可能会出现有害藻类水花，所产生的麻痹性贝毒(PSP)、致泻性贝毒(DSP)和其它神经毒素将会使收获中断。在牡蛎产卵后的2-3个月中通常不会进行采收，因为此时肉质不佳。

小规格牡蛎可以被作为特色“开胃食品”出售。它们的销售形式可以是带壳的鲜活产品，也可以是去壳的和冷冻加工产品、熏制和浸油的罐头、干牡蛎、提取的耗油或其它预制增值产品。

在没有粪大肠菌群的水体中生长的牡蛎仅需要进行最基本的加工。将它们洗净并按规格和形状分类，如果是底播养殖的牡蛎，可以将它们放入海水的流水式水箱中，冲去外套腔中的泥沙。如果牡蛎受到粪大肠菌的侵染，将需要经它们放入装有紫外光或臭氧灭菌设备的循环系统，进行一段时间的净化。对于供应半壳产品市场的单个牡蛎而言，包装时应将杯形壳至于下方以便保存外套膜的水分。如果包装得当而且置于冷藏条件下，产品的货架寿命可以达到7-10天。真空包装的增值半壳产品在欧洲的销售取得了一定的成功，尽管大部分贸易量是鲜活产品。在其他许多国家，收获后的牡蛎被运到加工厂去壳以提取牡蛎肉、装瓶、装罐或冷冻，或被用来制作耗油等预制产品。大部分国家对加工过程进行严格管理。

有关生产成本的信息很难获得，不仅仅是因为信息有所有权问题，而且还因为地点因素而导致使用的方法不同和所采用的技术水平差异很大。种苗供应通常占总成本的大约20–25。在发展中国家，育苗场生产的3–4 mm 贝苗售价在10–15美元/1 000个，用于远距离附着的成熟幼虫的成本需要约2美元/百万个（不包括运输费用）。与供应半壳市场的产品生产相比，为牡蛎肉贸易养殖的产品劳动和设备的集约化程度较低，而底层养殖比垂下式养殖（吊养）的成本要少。饲料并未被计算在成本里，因为一旦贝苗被转移到海水养殖地点，饲料便是一种免费资源。劳动力是主要的重复性开支，而且一般是季节性的。