Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y la Agriculturapara un mundo sin hambre
La principal ley que regula las actividades pesqueras en Japón es la Ley de Pesca (1949, revisada en 1962), la cual trata en detalle sobre varios tipos de derechos de pesca y licencias para individuos y grupos de personas japoneses. La Ley es administrada por el Ministerio de Agricultura, Silvicultura y Pesca (MASP), pero en la práctica muchas tareas se han delegado en los gobiernos de las prefecturas. Dentro del MASP, la Agencia de Pesca (AP) es la responsable de preservar y manejar/administrar los recursos biológicos marinos y las actividades de producción pesquera. La AP mantiene varios institutos de investigación, tal como el Instituto Nacional de Investigación de Acuicultura (INIA). En Japón, las aguas marinas están divididas en un número de áreas marinas como unidades administrativas para el ordenamiento pesquero. Con pocas excepciones, cada área marina corresponde esencialmente a la zona marítima de una prefectura costera. La Ley de Pesca establece las Comisiones de Ordenamiento Pesquero de Áreas Marinas y un Consejo Central de Ordenamiento Pesquero para tratar materias de política, implementación y cumplimiento de la Ley en cada área marina y para asegurar la coordinación del desarrollo pesquero prefectural dentro del marco nacional general. Las Comisiones de Ordenamiento Pesquero de Áreas Marinas caen bajo la jurisdicción conjunta del MASP y de los gobiernos de las prefecturas. La Ley de Asociación de Cooperativas Pesqueras (1948, enmendada) provee el marco legal para las Asociaciones de Cooperativas Pesqueras (ACPs) locales las cuales tienen la responsabilidad de un área geográfica particular y cuyos miembros son pescadores de las comunidades incluidas dentro de esa área. Dentro del marco establecido por las prefecturas, y según lo dicten las condiciones locales, cada ACP establece sus propias regulaciones para el control y funcionamiento de las operaciones pesqueras y la conservación y explotación racional de los recursos pesqueros. En términos de las operaciones del día-a-día, el sector pesquero japonés, aunque sujeto a un nivel de normativa más alto, es esencialmente auto-manejado por las ACPs o federaciones de ACPs. La Ley para Asegurar la Producción Sostenible de la Acuicultura (1999) 
busca evitar el deterioro ambiental auto-inducido alrededor de las granjas piscícolas. De acuerdo con esta ley, el MASP emitió las Pautas Básicas para Asegurar la Producción Sostenible de la Acuicultura (1999) y las ACPs desarrollaron e implementaron los "Programas para el Mejoramiento de las Áreas de Pesca", los cuales pueden ser desarrollados individualmente por una sola ACP, o conjuntamente por más de una ACP y que deben ser aprobados por las autoridades de las prefecturas.
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Los derechos de pesca son otorgados por el gobierno prefectural a las ACPs, las cuales distribuyen los derechos a sus miembros. Estos últimos se dedican a la acuicultura de acuerdo con las regulaciones y plan de manejo de las ACPs, aprobado por las autoridades de las prefecturas. Los derechos de pesca son exclusivos y no pueden ser entregados en préstamo, arrendados o transferidos a otros, ni tampoco se pueden hipotecar. Además de las ACPs, las organizaciones privadas y las personas particulares tienen derecho a solicitar derechos de pesca demarcados, pero el orden de prioridad establecido en la Ley de Pesca atiende primero a las ACPs.
Además, la Ley Ambiental Básica requiere que el gobierno establezca Estándares de Calidad Ambiental (ECA), i.e. niveles deseables de calidad del agua que se pretende alcanzar y mantener en las aguas públicas. Como se mencionó antes, estos estándares se establecen para alcanzar dos objetivos principales: la protección de la salud humana y la conservación del ambiente vivo. El primer objetivo se satisface estableciendo estándares nacionales uniformes y aplicables a todas las aguas públicas. Los estándares toman en consideración los potenciales riesgos para la salud asociados con la ingesta de substancias registradas, a través del agua de bebida y/o pescados y mariscos. El segundo objetivo se satisface clasificando los ríos, lagos, embalses y aguas costeras según el uso del agua y estableciendo los valores del ECA para cada clase. Estos valores son entonces aplicados a cada cuerpo de aguas públicas. Se ha establecido ECA especiales para preservar el ambiente de las aguas subterráneas. Todos los estándares y valores están disponibles en http://www.env.go.jp/en/laws/. La Ley relacionada con la Prevención de la Contaminación Marina y los Desastres Marinos (1970) busca regular - inter alia - la eliminación, vertimiento y quemado de petróleo, substancias líquidas peligrosas y residuos desde embarcaciones e instalaciones marinas.
, por ejemplo, trata sobre la regulación de los productos químicos agrícolas (incluyendo pesticidas). La Ley de Asuntos Farmacéuticos (1960)
regula las drogas y medicamentos veterinarios y los aparatos/dispositivos médicos veterinarios. La Ley especifica, entre otras cosas, el cómo deben ser puestas a prueba y aprobadas estas drogas/medicamentos y aparatos/dispositivos, publicitados, embalados, utilizados, etc., y bajo qué circunstancias pueden ser recetados. Aunque la Ley es administrada por el Ministerio de Salud, Trabajo y Bienestar, el MASP supervisa su aplicación en lo que concierne a drogas y medicamentos veterinarios. Según se informa, en 1995, la Agencia de Pesca emitió un panfleto para guiar a los acuicultores y piscicultores en relación con el uso de drogas y medicamentos en acuicultura indicando, por ejemplo, las especies en las cuales son usados, el método y cantidad de la administración y el tiempo desde el cual se termina la administración hasta cuando el producto es cosechado y llevado al mercado (período de carencia).
tiene como intención regular la calidad de los alimentos para ciertos animales según lo indica la Ley. Se incluye a varias especies pesqueras.
, que trata sobre la evaluación de riesgos, y por la Ley sobre Sanidad de Alimentos (1947, enmendada), que trata sobre el manejo de riesgos. La Ley sobre Sanidad de Alimentos, que es administrada por el Ministerio de Salud, Trabajo y Bienestar (MSTB), en particular por el Departamento de Seguridad de Alimentos bajo la Oficina de Fármacos y Seguridad de Alimentos, puede dividirse en dos partes. La primera parte trata sobre el establecimiento de estándares, incluyendo especificaciones y estándares para alimentos, estándares para etiquetado, estándares para instalaciones y estándares para manejo/operación. La segunda parte de la Ley trata sobre inspecciones y orientación, incluyendo la inspección por el gobierno nacional de los productos alimentarios importados y las inspecciones y orientación por los gobiernos local y municipal para negocios nacionales de alimentos. Se han establecido diversas especificaciones y estándares para mariscos (i.e. relativos al procesamiento, almacenamiento, etiquetado, etc.) basados en la Ley sobre Sanidad de Alimentos, Se puede encontrar más información sobre estas especificaciones y estándares, incluyendo límites máximos de residuos para pesticidas y medicamentos veterinarios, en los siguientes documentos:
No hay referencia específica a la inversión en el sector de la acuicultura. Se puede encontrar más información sobre inversión en Japón en: http://www.jetro.go.jp/investjapan/. OGMsEl MASP emitió las Pautas para la Aplicación de Organismos DNA Recombinantes en Agricultura, Silvicultura, Pesquerías, la Industria de Alimentos y Otras Industrias Relacionadas (2000). El propósito de estas Pautas es establecer los requerimientos básicos relacionados con la aplicación adecuada de organismos con DNA recombinante en agricultura, silvicultura, pesca y en la industria de alimentos, así como en otras industrias relacionadas reguladas por el MASP, para asegurar el uso sin peligro de organismos con DNA recombinante y lograr, en general, el desarrollo sensato de las agro-industrias.
Ley que Regula los Productos Químicos Agrícolas (1948, enmendada) (The Agricultural Chemicals Regulation Law (1948, as amended)). (Copia no disponible) Pautas para la Aplicación de Organismos DNA Recombinantes en Agricultura, Silvicultura, Pesquerías, la Industria de Alimentos y Otras Industrias Relacionadas (2000) (Guidelines for Application of Recombinant DNA Organisms in Agriculture, Forestry, Fisheries, The Food Industry and Other Related Industries (2000))
Ley de Evaluación de Impacto Ambiental (1997) (Environmental Impact Assessment Law (1997))
Ley Ambiental Básica (1993) (Basic Environmental Law (1993))
Ley de Pesca (1949) (Fisheries Law (1949))
Ley Básica sobre Seguridad de Alimentos (2003) (Food Safety Basic Law (2003)). (Copia no disponible) Ley sobre Sanidad de Alimentos (1947, enmendada) (Food Sanitation Law (1947, as amended))
Ley de Asociación de Cooperativas Pesqueras (1948, enmendada) (Fisheries Cooperative Association Law (1948, as amended))
Ley sobre Garantía de Seguridad y Mejoramiento de la Calidad de Alimentos (1953) (Law concerning Safety Assurance and Quality Improvement of Feed (1953)). (Copia no disponible) Ley para Asegurar la Producción Sostenible de la Acuicultura (1999) (Law to Ensure Sustainable Aquaculture Production (1999)). (Copia no disponible) Ley para Enmendar Parcialmente la Ley sobre la Protección de los Recursos Pesqueros (1996) (Law to Partially Amend the Law on the Protection of Fishery Resources (1996))
Ley de Asuntos Farmacéuticos (1960) (The Pharmaceutical Affairs Law (1960)). (Copia no disponible) Ley de Control de la Contaminación del Agua (1970, enmendada) (Water Pollution Control Law (1970, as amended))
Administration and conflict management in Japanese coastal fisheries. FAO Fisheries Technical Paper 273.1992.  Arthur, J.R., Lavilla-Pitogo, C.R. and Subasinghe, R.P. (eds). Use of Chemicals in Aquaculture in Asia, Proceedings of the Meeting on the Use of Chemicals in Aquaculture in Asia. Tigbauan, Iloilo, Philippines, 20 – 22 May 1996. National Profile on Chemicals Management. Japan. 2003 Van Houtte, A. 2001. Establishing legal, institutional and regulatory framework for aquaculture development and management. In: R.P. Subasinghe, P. Bueno, M.J. Phillips, C. Hough, S.E. McGladdery & J.R. Arthur, eds. Aquaculture in the Third Millennium. Technical Proceedings of the Conference on Aquaculture in the Third Millennium, Bangkok, Thailand, 20-25 February 2000. pp. 103-120. NACA, Bangkok and FAO, Rome.
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