渔业及水产养殖部的总体目标是促进从收获到餐桌的可持续渔业生产，其中重点放在优化捕捞和养殖鱼类的利用方面，目的是从渔业资源中获取最大价值，同时对可持续渔业规范提供支持。

其活动主要围绕总的全球鱼品利用，目标是：

• 减少收获后损失：以安全质量 - 包括水产养殖产品 – 增值和小型加工为重点
• 贸易和销售：特别是改善国内鱼品市场以及市场准入要求
• 贸易与环境：包括所有根据世贸组织和濒危野生动植物种国际贸易公约（CITES）决定形成的国际协定，有关标签和认证要求，食品安全问题和市场准入信息

粮农组织渔业及水产养殖部编制有关产品安全、利用、销售和负责任贸易的行为守则和标准。