《濒危物种公约》附录包括若干商业捕捞的鱼类和无脊椎水生物种,其中包括

  • 路氏双髻鲨,Sphyrna lewini (2014年 - 附录II)
  • 无沟双髻鲨,Sphyrna mokarran(2014年 - 附录II
  • 锤头双髻鲨,Sphyrna zygaena (2014年 - 附录II)
  • 长鳍真鲨,Carcharhinus longimanus (2014年 - 附录II)
  • 鼠鲨,Lamna nasus(2014年 - 附录II)
  • 蝠鲼,Manta spp(2014年 - 附录II)
  • 欧洲鳗鲡 ,2007年 - 附录II)
  • 锯鳐科(2007年 - 附录I,但1种列于附录II
  • 苏眉鱼,Cheilinus undulatus (2004年 - 附录II)
  • 金石蛏,Lithophaga lithophaga (2004年 - 附录II)
  • 白鲨Carcharodon carcharias (2004年 - 附录II)
  • 海参,Isostichopus fuscus(2003年 - 附录III)
  • 姥鲨,Cetorhinus maximus (2002年 - 附录II)
  • 海龙和海马,Hippocampus spp (2002年 - 附录II)
  • 鲸鲨Rhincodon typus(2002年 - 附录II)
  • 鲟鱼,Acipenseriformes(1997年 - 附录II,但2种列于附录I)
  • 大凤螺,Strombus gigas(1994年 - 附录II)
  • 石珊瑚,Scleratinia(1990年 - 附录II)
  • 大砗磲,Tridacnidae (19834年 - 附录II)
  • 巨骨舌鱼,Arapaima gigas(1975年 - 附录II)

《濒危物种公约》还给一些非有鳍鱼类带来重大影响,它们包括重要海洋主捕或兼捕物种。例如,除了所有海龟品种之外,几种鲸鱼及种群也被纳入附录I。

在1997年举行的第十次缔约方大会上,《濒危物种公约》更多地涉及水生物种渔业问题引起了粮农组织成员国对于《公约》被应用于商业性利用水生物种的关注。渔委和鱼品贸易分委员会的讨论显示出各国在《濒危物种公约》作为辅助工具促进旨在保护和推动渔业资源可持续利用的传统渔业管理的作用方面缺乏共识。另一方面,各国一致认为有必要加大国家在编制鱼类种群列表议案以及粮农组织在评估这些议案方面的投入力度

被特别提及的还包括优化《濒危物种公约》附录中物种增列的标准和准则,以反映出水生资源的具体特点。作为上述讨论的后续工作,2003年渔委第二十五届会议批准了粮农组织关于《濒危物种公约》有关商业性利用水生物种的一项实质性工作计划。

 
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