全球农业文化遗产系统计划的总体目标是确定和保护全球重要农业文化遗产系统及其相关景观、农业生物多样性和知识系统。具体做法是推动和制定长期计划来支持此类系统，并通过其动态保护、可持续管理和增强生存能力来增进全球、国家和地方惠益。

为实现上述目标，制定了如下具体目标：

1. 利用全球和各国对农业文化遗产系统重要性的认识以及对其保护的机构支持；
   • 通过创建由政府、粮农组织治理机构、联合国教科文组织、世界遗产中心及其他伙伴支持的农业文化遗产系统类别，获得了全球认可：
   • 通过更好地了解此类农业系统面临的威胁、其全球重要性及其在各层面提供的惠益，提高国家的认识和意识。
2. 通过地方农业社区以及地方和国家机构能力建设，以可持续的方式保护和管理全球重要农业文化遗产系统，创造收入，并为这些系统的产品和服务增加经济价值；
   • 确定如何减轻生物多样性和传统知识受到侵蚀的风险、土地退化和全球化进程带来的威胁以及扭曲的政策和激励措施；
   • 加强生物多样性和自然资源的保护和可持续利用，减少对气候变化的脆弱性，加强可持续农业和农村发展，从而促进粮食安全和减贫；
   • 提高当地居民从保护和可持续利用其资源及其巧妙的系统中获得的回报，并通过支付环境服务、生态标签、生态旅游和其他激励机制和市场机会为其带来回报。
3. 促进支持性监管政策和激励性环境，以支持全球重要农业文化遗产系统的保护、进化适应和生存能力；
   • 评估现有政策和激励机制，并确定支持可持续农业做法的模式；
   • 推动国家和国际进程，从而改善政策和激励机制。