En el marco del Proyecto de la FAO sobre la bioenergía y criterios e indicadores para la seguridad alimentaria se ha compilado un conjunto de 30 metodologías que pueden ser utilizadas para evaluar, tanto en las etapas de planificación como de seguimiento, las principales repercusiones medioambientales que derivan de la producción y explotación de la bioenergía. Las metodologías pueden conducir a dar sostenibilidad a las operaciones del sector bioenergético. El desarrollo de los sistemas de bioenergía modernos puede dar lugar a efectos positivos y negativos (directos e indirectos) en las cuatro dimensiones de la seguridad alimentaria: la disponibilidad, el acceso, la utilización y la estabilidad del suministro de los alimentos. Por ejemplo, gracias a la bioenergía pueden crearse nuevas oportunidades de empleo y de ingresos que tienen resultados positivos en el acceso de las personas a los alimentos. Pero al mismo tiempo, en ausencia de buenas prácticas la producción de bioenergía puede determinar efectos adversos, por ejemplo en la capacidad productiva de las tierras o en la disponibilidad y la calidad del agua, con consiguientes consecuencias negativas en la seguridad alimentaria.