当今技术、文化和经济的快速发展，正威胁着许多农业文化遗产及其生物多样性和社会环境基础。在过去的几十年里，人们高度关注农业生产能力、专业化水平和全球市场，而忽视了相关的外部性与适应性管理的策略，导致全面忽视对这些多种多样、独具特色的农业生产系统的研究和发展的支持。生存的压力阻碍了农民的创造性，迫使他们采用不可持续的生产方式，过度开发自然资源导致生产力水平下降，实施农业专业化生产，引进外来物种等。

自然，这就带来了严重的基因污染、相关知识体系和传统文化的丧失以及重要的全球性遗产传承断裂的风险，并可能将社区拖入到贫穷和社会经济动荡的恶性循环之中。

如果不采取有效措施帮助这些农业生产系统应对所面临的威胁，那么GIAHS将难以避免世界上无数的农村社区消失于工业化、现代化和全球化浪潮中的厄运。