Diversas instituciones financieras colaboran con la FAO en la elaboración y ejecución de los proyectos del PESA, sobre todo los bancos regionales de desarrollo. La FAO y el Banco Internacional de Desarrollo (IDB) colaboran con tres organizaciones económicas regionales (CARICOM/CARIFORUM, CAN, CORECA-CAC y MERCOSUR) en América Latina y el Caribe. Trabajan juntos en la lucha regional contra la pobreza coordinado estrategias regionales y subregionales, programas y proyectos orientados a fomentar el desarrollo sostenible agrícola y rural y la seguridad alimentaria.

El Banco de Desarrollo del África Occidental (BOAD) financia proyectos del PESA por más de 27 millones de USD. El  Banco Africano de Desarrollo (BAfD) financia proyectos del PESA en ocho países de África: el Camerún, Cabo Verde, Ghana, Guinea, Malawi, Mauritania, Mozambique y Tanzanía, con un presupuesto aproximado de un millón de USD por proyecto. El Banco Islámico de Desarrollo (BID) financia varios proyectos, de los cuales el último es uno de CSS entre Gambia y Bangladesh.

Otras instituciones de financiación que contribuyen al PESA son:

• Banco Árabe para el Desarrollo Económico de África (BADEA)
• Banco Asiático de Desarrollo (BAD)
• Fondo de las Naciones Unidas para la Colaboración Internacional (UNFIP)
• Banco de Desarrollo del África Occidental (BOAD)
• Unión Económica y Monetaria de África Occidental (UEMAO)