Los programas regionales para la seguridad alimentaria (PRSA) apoyan la integración y el desarrollo económico de la agricultura entre países en desarrollo vecinos. Los gobiernos de casi todo el mundo han formado organizaciones económicas regionales para tratar asuntos de interés común. Se promueve que estas organizaciones formulen y ejecuten programas regionales destinados a:

1. sensibilizar al público sobre la importancia vital de la seguridad alimentaria y nutricional;
2. formular estrategias y políticas regionales para el comercio agrícola y de alimentos;
3. dar compatibilidad a las cuestiones fronterizas y a las normas para la inocuidad de los alimentos que repercuten en el comercio de alimentos y otros productos agrícolas;
4. promover inversiones en infraestructura regional de comunicaciones e información de mercado;
5. dar apoyo a las actividades nacionales destinadas a los pequeños agricultores para que éstos sean más eficientes y encuentren nuevos mercados para sus productos; y
6. incorporar la gestión de los recursos naturales, la lucha contra las enfermedades de los animales y las plagas, el comercio.

Hasta mediados de 2007 la FAO ha contribuido a la formulación de más de 20 programas regionales. Las siguientes tres organizaciones regionales llevaron a cabo estas actividades:

• CARICOM/CARIFORUM (Foro de la Comunidad del Caribe).
  En 2002 se preparó un programa regional en estrecha colaboración con la Secretaría del CARICOM/CARIFORUM, aprobado después por el Consejo de Ministros al que competen el Comercio y el Desarrollo. Este PRSA de 26 millones de USD beneficia a 15 pequeños países insulares en desarrollo. Se financia parcialmente a través del  Fondo fiduciario de la FAO para la seguridad alimentaria y la inocuidad de los alimentos (con 5,3 millones de dólares de recursos aportados por Italia), además de otro millón de dólares de otros fondos fiduciarios y casi cinco millones de dólares del Programa de Cooperación Técnica de la FAO. Ya se aprobó otra segunda fase ampliada del programa.
• Foro para el Pacífico
  Un programa regional ayuda a 14 pequeños países insulares en desarrollo. Se creó en febrero de 2002, con un presupuesto de 11,47 millones de USD Lo financia en parte el Fondo fiduciario de la FAO para la seguridad alimentaria (con 7,064 millones de dólares de recursos aportados por Italia) y 2,8 millones de dólares adicionales del Programa de Cooperación Técnica de la FAO. Ya se formuló y aprobó la segunda fase ampliada del Programa.
• UEMAO (Unión Económica y Monetaria del África Occidental)
  Programa regional de ocho países de la Unión, recibe apoyo del fondo fiduciario de la UEMAO (cuatro millones de dólares) y de tres proyectos del Programa de Cooperación técnica (por un millón de dólares), para actividades fitosanitarias, zoosanitarias y de inocuidad de los alimentos. Se está preparando otra fase ampliada del Programa.

El PRSA de la Comunidad de Estados Sahelo-Saharianos (CEN-SAD) está formulándose.

En 2005 se preparó un programa regional en colaboración con la Organización de Cooperación Económica y el Banco Islámico de Desarrollo (BIsD) de 11 perfiles de proyectos regionales por un presupuesto total de 210,76 millones de dólares. Está en ejecución sólo uno de estos proyectos regionales, para el Asia central.

Los programas regionales se financian a través del Fondo fiduciario de la FAO para la seguridad alimentaria y donaciones del Programa de Cooperación Técnica , en las etapas de elaboración, formulación y ejecución.