Les Programmes régionaux épaulent les programmes nationaux par le biais d'activités de renforcement des capacités et de sessions de formation organisées avec les représentants des pays.

Le programme régional de l'UEMOA (Union économique et monétaire ouest-africaine) s'efforce d'améliorer les capacités nationales de surveillance et de contrôle du commerce des produits animaux à l'intérieur de la région. Une initiative consiste à sélectionner dans la région des experts chargés de former des inspecteurs sanitaires locaux capables de tester et évaluer les produits carnés et d'appliquer les règlementations en matière de mise en quarantaine des animaux. Le Programme régional a organisé un atelier de trois jours en avril 2007 sur l'exécution de la composante nationale et l'élargissement de la composante régionale.