Le Programme de coopération FAO/gouvernements est le principal programme du Fonds fiduciaire de la FAO, l'approbation des dépenses s'élevant récemment à près de 135 millions de dollars E.-U. en 2004 (comparées aux 1.5 millions de dollars E.-U en 1970). Dans ce type de programme, l'assistance est en général fournie par un pays développé et canalisée vers un seul pays bénéficiaire, un groupe de pays au sein d'une même région (projet régional) ou un groupe de pays de diverses régions (projet interrégional).

Les programmes du Fonds fiduciaire ne sont pas nécessairement financés par un seul et unique donateur; certains le sont par plusieurs. Des exemples de fonds fiduciaires multi donateurs couronnés de succès sont le programme qui a contribué à éradiquer la lucilie bouchère, la peste aviaire, la reconstruction du Tsunami et la campagne de la FAO contre les criquets pèlerins qui illustrent tous la capacité de la FAO à faciliter et catalyser des initiatives de développement de manière efficace.

En 2004, environ soixante pour cent des contributions versées au programme de coopération FAO/gouvernements provenaient de neuf sources, à savoir: l’Union Européenne (25 pour cent), les Pays-Bas (22 pour cent), l’Italie (12 pour cent), la Norvège (10 pour cent), l’Allemagne et le Royaume Uni (9 pour cent chacun), le Japon et les Etats Unies (7 pour cent chacun), la Belgique (6 pour cent). Cette nouvelle répartition reflète la tendance vers la diversification des sources de financement. Par exemple, au cours de la période précédente, de 1994 à 2002, deux pays seulement - les Pays-Bas (32 pour cent) et l'Italie (22 pour cent) - fournissaient 54 pour cent de toutes les contributions.