ويشكّل المجلس الجهاز التنفيذي للمؤتمر. وهو يضمّ 49 عضواً ويفوّضه المؤتمر سلطاته. ويعقد المجلس أربع دورات له على الأقلّ بين الدورات العادية للمؤتمر. وتتمحور وظائفه بشكل أساسي حول حالة الأغذية والزراعة في العالم والمسائل ذات الصلة، فضلاً عن الأنشطة الحالية والمتوقعة للمنظمة، بما في ذلك برنامج العمل والميزانية والمسائل الإدارية والإدارة المالية للمنظمة والقضايا الدستورية.