يواجه عـديد من بلدان الإقليم مصاعب تتعلـق بنـدرة الموارد المائيـة، والاستغلال المبـالغ فيـه لموارد الميـاه الجوفيـة، ومحدوديـة الأراضى الخصبـة، وتدهـور التربـة، والتلـوث، والاستخدام غير الملائم للأسمدة والمبيـدات وتكرار حالات الجفاف. وبهدف معالجـة هذه القضايا، سوف يسعى المكتب الإقليمي نحو التالي:

• مساعدة الـدول الأعضاء فـي مراجعة، وصياغة، وتنفيـذ سياسـات إدارة الميـاه وإدخال المعاييــر التنظيمية للمياه من أجل تشجيع الاستثمارات في مجال الري. والطبيعية.

• المسـاهمة في تنمية القدرات القطرية على تطبيق إجراءات فعالة لإدارة الطلب على المياه وإدارة مستجمعات المياه، ودعم الإصلاحات المؤسسية، وتنظيم المستفيدين من المياه مثل روابط مستخدمي المياه (WUAs) ومشاركتهم في إدارة مشروعات الري.

• المساعـدة على تعبئة الموارد المالية وزيادة الاستثمارات فـي قطاعات الزراعة والغابات والأسماك.

• ترويج استخـدام الموارد المـائية غير التقليـدية بما في ذلك الاستخدام الآمن للميـاه العادمة المعـالجة والميـاه العسـرة والمياه المالحة.

• تدعيم النظم القطرية للبحوث الزراعية و الإرشاد من أجل تنمية الزراعة المستدامة.