Les commissions régionales sont des forums de discussion pour tous les Etats membres de la région au sein desquelles ils peuvent échanger des idées, discuter des dossiers en cours et partager des ressources avec les techniciens et spécialistes de la FAO.

Il existe deux commissions régionales en Afrique: la Commission africaine des statistiques agricoles (CASA) et la Commission des forêts et de la faune sauvage pour l'Afrique (CFFSA). Ces organes se réunissent tous les deux ans, se voient allouer une part du budget de la FAO et bénéficient des services d'un secrétaire technique chargé des opérations.

• Commission africaine des statistiques agricoles
  La CASA rassemble des fonctionnaires principaux chargés des statistiques issus des États Membres africains de la FAO, dont la mission est de développer les statistiques agricoles dans leurs pays respectifs. Ces spécialistes examinent et échangent des idées sur la situation des statistiques relatives à l'alimentation et à l'agriculture sur le continent et conseillent les États Membres quant au développement de leurs systèmes de statistiques agricoles dans le cadre du Programme de travail et budget de la FAO pour l'Afrique.
• Commission des forêts et de la faune sauvage pour l'Afrique
  La Commission des forêts et de la faune sauvage pour l'Afrique, créée en 1959 par la Conférence de la FAO, offre une enceinte spécialisée dans les politiques et les aspects techniques au sein de laquelle les pays africains peuvent débattre des questions liées aux forêts et y apporter des solutions à l'échelon régional. Sur la base des expériences régionales, elle prête aussi des avis au programme forestier de la FAO.