إن معرفة مكان حدوث صدأ ساق القمح أمر مهم، ولكن المعلومات بشأن السلالات الموجودة ووتيرتها تكتسي أهمية حيوية بالنسبة للتوصيات الخاصة بالتربية والأصناف. والطريقة الوحيدة لتحديد تركيبات الفوعة والسلالة أو السلالات المحددة الموجودة هي إجراء اختبارات بيولوجية تحت ظروف خاضعة للرقابة، باستخدام مجموعات من الاختبارات التمايزية (تحليل السلالة). وقد أجريت تحليلات السلالة لمسببات مرض صدأ الحبوب في كثير من البلدان لسنوات عديدة باستخدام منهجيات موحدة إلى حد ما من التلقيح والحضانة وبعد ذلك "قراءة" المجموعات (تسجيل البيانات).
ومع تحديد سلالة Ug99 ومشتقاتها، من الأهمية بمكان الحصول على المعلومات بشأن (1) التوزيع الحالي لمختلف السلالات، و(2) الاختلاف الموجود في مسبب مرض صدأ ساق الحبوب. وتقدم معاهد البحوث المتقدمة الدعم التقني بشأن تحليل السلالة؛ ولا سيما مختبر الزراعة والأغذية الزراعية (Agriculture and Agri-Food Lab)، وينيبيغ، كندا، ومختبر أمراض الحبوب ( Cereals Disease Lab) في ولاية مينيسوتا، الولايات المتحدة الأمريكية، وجامعة فري ستيت، جنوب أفريقيا، ومعهد تربية النباتات ( PBI) جامعة سيدني، أستراليا. وبالإضافة إلى ذلك، تعزز القدرات داخل البلدان على إجراء تحليل السلالة في العديد من البلدان الشريكة المعرضة للخطر.
وتقدم لمحة تخطيطية للبروتوكول العام المستخــدم لتحليل السلالة فـــي الشكل المرفق. وفي ما يلي مخطط وجيز للعملية:
- تجمع عينات من السيقان المصابة بعد الكشف عن إصابات بصدأ ساق القمح في المزارع. وتُزال الساق الأساسية؛ وتحفظ العينات في أوراق أو مغلفات عازلة وتجفف.
- بالنسبة للتحاليل في أمريكا الشمالية، ترسل العينات تحت رخصة استيراد بعد بروتوكولات صارمة للصحة النباتية.
- تنقل جراثيم الصدأ من الأنسجة المصابة إلى أوراق متمتعة بالصحة من شتلة من مجموعة حساسة للغاية. وتؤدي هذه الزراعة الفرعية إلى زيادة كمية الصدأ في إحدى العينات.
- تتحقق العدوى باستخدام علاج الندى لمدة عن 12-16 ساعة في ظل ظروف مظلمة عند درجة 21 مئوية، يليه التعرض للضوء لمدة 3-4 ساعات. وبعد 13-14 يوما من الحضانة عند 18-25 درجة مئوية، تظهر العدوى.
- يمكن جمع الجراثيم من الأوراق المصابة واستخدامها في تلقيح مجموعة مختلفة كبثرة كلية أو واحدة. وإن استخدام بثرة واحدة يزيد من فرص العمل مع سلالة واحدة.
- للحصول على بثرة واحدة، يتم زرع الجراثيم بطريقة فرعية وتكثيرها مرة أخرى على المضيف الحساس. وبعد عملية التكاثر، تلقح مجموعة مختلفة. وتتألف هذه المجموعة من مورثات تحتوي على جينات مقاومة رئيسية واحدة لصدأ ساق القمح. ويجري الآن استخدام مجموعة تمايزية دولية موحدة لكي يتسنى إجراء مقارنة عالمية.
- يتم تقييم أنواع إصابة الشتلات على مجموعة تمايزية باستخدام سلم تقييم موحد يتراوح بين 0 و4. وتعتبر أنواع الإصابة المنخفضة (0-2) على أنها تتسم بالمقاومة، وأنواع الإصابة (3-4) على أنها حساسة. وتحدد السلالات على أساس مزيج من أنماط الفوعة أو عدمها.
