المراكز المرجعية للفاو عبارة عن مؤسسات يعيّنها المدير العام لتوفير المشورة المستقلة الفنية/العلمية المحددة بشأن المسائل المتعلقة بولاية الفاو. وتنوي الفاو تعيين ما يناهز الخمسين مركزاً مرجعياً في مجال الصحة الحيوانية، وقد حدّدت 18 مجالاً فنياً تتطلب التعاون مع المراكز المرجعية حالياً. وسيتم تحديد مجالات أخرى وفقاً للحاجة.

تتمثل إحدى مهام الفاو العالمية في توفير الدعم الميداني والفني للدول الأعضاء لديها للوقاية من ، الأمراض الرئيسية التي تصيب الدواجن، والماشية، والحيوانات البرية ولمكافحتها. ويمكن للفاو أن تضطلع بالتزاماتها على نحو أفضل في النهوض بسبل العيش وفي الحفاظ على صحة الحيوانات بالشراكة مع مؤسسات (أكاديمية، وبحثية، ومختبرات، وغيرها) تتمتع بالخبرة في مجالات التشخيص البيطري، واللقاحات، والأبحاث والاحتواء البيولوجي، وعلم الأوبئة، وصحة الحيوانات البرية. وتُعتبر المراكز المرجعية التي عينتها الفاو مراكز امتياز في توفير الخبرة العلمية والفنية، وخدمات التشخيص، والتدريب المخبري والميداني، وتنسيق الأبحاث، والدراسات التطويرية، والإسهام في مشاريع الفاو. ويُتوقع من المراكز المرجعية أن توفر المساعدة والخبرة في:

• الوقاية من الأمراض الحيوانية العابرة للحدود ورصدها، بما في ذلك الأمراض الحيوانية المنشأ، وتحسين إدارة المخاطر والأمراض؛
•  تعزيز فهم، وتحليل العوامل التي تسهم في انتشار الأمراض، واستمرارها، وانتشارها؛
• دعم إنتاج حيواني أسلم، كجزء من الجهود المبذولة من أجل التنمية الاقتصادية، والأمن الغذائي، والسلامة الغذائية، والتخفيف من الفقر؛
•  تحسين خدمات الصحة البيطرية العامة؛
•  توجيه السياسات المتصلة بالصحة الحيوانية.