La definición de planes estratégicos sectoriales como instrumentos para la gestión de política pública, que articulan directrices en el corto, mediano y largo plazo, tiene en el sector agropecuario la necesidad de promover actividades basadas en Investigación, desarrollo e innovación, que respondan a especificidades de regiones, áreas temáticas, cadenas productivas, sistemas productivos, megatendencias, a partir del diseño de política pública. El propósito de este trabajo es presentar el diseño metodológico como caso de estudio, implementado para la construcción de políticas públicas en el sector agropecuario-agroindustrial de Colombia, basado en la integración de elementos de gestión estratégica e inteligencia competitiva a través de la herramienta de itinerarios de ruta, que contempla cinco fases. La sinergia de estas cinco fases converge en el Plan Estratégico de Ciencia, Tecnología e Innovación del Sector Agropecuario Colombiano 2017-2027 de Colombia - PECTIA.