本技术手册首先介绍了鱼菜共生的概念，包括其发展简史及其在无土栽培和现代农业大范畴中的地位。随后是鱼菜共生的主要理论框架，包括氮循环和硝化作用、细菌的作用、鱼菜共生系统均衡的概念；接着介绍了重要的技术内容，包括水质参数、水质测试和鱼菜共生的水源，以及系统设计的一些方法和理论，包括三种主要的鱼菜共生系统：基质床栽培、营养膜栽培和深水栽培。本手册详细介绍了鱼菜共生生态系统组成的三类生物（细菌、植物和鱼类），手册还介绍了管理策略和故障排除方法以及相关的话题，尤其强调了鱼菜共生投入品中当地可持续材料的使用。本手册还包含九个附录，介绍了其他重要内容：鱼菜共生中常见植物生长的最适条件；常见病虫害的化学和生物防治，包含一份共用的种植指南；常见鱼病及其症状、病因以及治疗方法；在鱼类种群量和投饲量一定的条件下，计算生成的氨含量和所需的生物过滤介质数量；自制鱼饲料的生产；建立鱼菜共生系统装置的步骤和注意事项；小规模基质栽培鱼菜共生系统的成本收益分析；构建三种小规模鱼菜共生系统的综合指导步骤；以及本手册的简要总结，用作拓展、延伸和教育的补充材料。