Existem vários pacotes de programas para microcomputadores que podem ser utilizados com o presente manual, em particular o pacote Length-based Fish Stock Assessment (LFSA) desenvolvido pela FAO (Sparre, 1987) e o pacote COMPLEAT ELEFAN desenvolvido pela ICLARM (Gayanilo, Soriano e Pauly, 1988). Estes dois pacotes de programas são complementares e os ficheiros criados num, podem ser utilizados noutro. A grande sobreposição e a simultânea utilização de ambos os pacotes de programas nos cursos de formação de avaliação de mananciais pesqueiros da FAO/DANIDA, levou ao desenvolvimento dum novo pacote cujo título é “FAO-ICLARM Stock Assessment Tools” ou FiSAT, que integra não só rotinas contidas nos dois pacotes em cima mencionados, como outras rotinas.
O pacote de programas para microcomputadores LFSA (Length-based Fish Stock Assessment), que está escrito em BASIC, foi desenvolvido para acompanhar o presente manual, assim os programas seguem exactamente os procedimentos apresentados nos capítulos anteriores.
O pacote LFSA foi inicialmente desenvolvido para computadores Apple II, como está referido no título (Sparre, 1987), mas foi posteriormente convertido em uma versão compatível com computadores IBM. Enquanto que a versão IBM foi melhorada e ampliada com o tempo, a versão Apple manteve-se igual.
O pacote LFSA pode ser utilizado em microcomputadores do tipo Apple II e IBM (PC, XT ou AT) ou os seus compatíveis, desde que tenham a memória mínima, um écrã monocromático e uma impressora de 80 colunas. Os gráficos da versão IBM estão baseados no IBM Color Graphics Monitor Adapter (gráficos de alta resolução, 640*200).
Como os programas são executados através de diálogos no écrã de uma forma didáctica, não se exige um conhecimento prévio de BASIC nem do sistema operativo (PRODOS no Apple II e MS-DOS no IBM) para a utilização deste pacote,. O “prompt” apresenta-se como um “menu” do qual o utilizador escolhe uma via de análise para o tratamento de dados. Além dos programas que tratam dos métodos descritos neste manual, o pacote LFSA contem vários programas de utilidade para tratamento e processamento inicial de dados.
O pacote LFSA não inclui todos os métodos descritos neste manual uma vez que foi dada ênfase na incorporação de procedimentos demorosos como a análise de Bhattacharya.
A Fig. 15.1.1 mostra um fluxograma da parte mais importante do LFSA, que é a parte da análise de frequências de comprimento.
LFINPUT: Programa de entrada/edição de dados LF. Este programa é utilizado para a entrada/edição de dados de frequências de comprimento e para a sua gravação em disco duro ou disquete (o tipo de dados necessários para a análise de progressão modal, cf. Secção 3.4.2). O LFINPUT ordena automaticamente as amostras de frequências de comprimento em ordem cronológica.
LFINF: Programa para dados LF adicionais (informação). Este programa é uma continuação opcional do LFINPUT, permitindo adicionar uma variedade de dados, a cada amostra de frequências de comprimento como por exemplo o esforço, captura total, posição, profundidade, arte de pesca, tipo de fundo, etc.
Fig. 15.1.1.1 Fluxograma dos principais programas do sub pacote do LFSA, de análises de frequências de comprimento (não estão incluidos todos os programas)
LFTABLE: Programa de criação de tabelas LF.
Programa que produz tabelas de séries temporais de frequências de comprimento
consoante a escolha do utilizador.
LFBAR e LFGRAPH: Programas de criação de histogramas LF.
LFSUM: Programa de adição de dados LF.
Este programa proporciona várias possibilidades para a adição e ampliação
das amostras de frequências de comprimento (cf. Cap. 7).
LFCONV: Programa de conversão de dados LF.
Pode-se dar o caso de dados de diferentes fontes possam ser incompatíveis,
por exemplo se a medida for o comprimento furcal para algumas amostras e o
comprimento total para outras. Mesmo que a fórmula de conversão seja
simples, não é facil converter dados agrupados. O LFCONV pode resolver este
e outros problemas similares pois também pode ser utilizado para a conversão
de categorias de tamanhos comerciais (por exemplo no de caudas de camarões
por libra) para frequências de comprimento. LFCONV é uma versão ampliada do
LFINPUT.
LFMANI: Programa de manipualção de dados LF.
Este programa oferece algumas opçães como por exemplo o cálculo do peso na
amostra através da relação peso-comprimento (cf. Secção 2.6), uma alteração
das classes de comprimento de 1 cm a 2 cm, uma conversão para frequências
relativas, uma correção por causa da selectividade da arte de pesca (cf.
Secção 6.7), etc.
LFMERGE: Programa de junção de ficheiros LF.
Este programa é utilizado para a junção de ficheiros de diferentes séries
temporais, tomando em conta as suas ordens cronológicas.
LFSELEFA: Programa para conversão LFSA/ELEFAN.
Conversão de ficheiros de frequências de comprimento em formato LFSA para o
formato COMPLEAT ELEFAN e vice-versa.
BHATTAC: Programa para a análise de Bhattacharya.
Aplicação da análise de Bhattacharya, descrito na Secção 3.4.1, produzindo
gráficos no écrã que podem ser imprimidos.
BHGRAPH: Programa de gráficos da análise de Bhattacharya.
Mostra os gráficos resultantes da análise de Bhattacharya em alta resolução
(só na versão IBM), que se assemelham a Fig. 3.2.2.2.
MODALGR: Gráficos e resultados da análise de Bhattacharya.
Produz um gráfico semelhante à Fig. 3.4.2.1 e a Tabela correspondente (cf.
Tabela 3.4.2.1). Os dados de entrada para o MODALGR são os resultados do
programa BHATTAC.
MODALPR: Análise de progressão modal.
Esta é a análise descrita na primeira parte da Secção 3.4.2, ou seja a
estimação dos parâmetros de crescimento pelo gráfico de Gulland e Holt (cf.
Tabela 3.4.2.3 e Fig. 3.4.2.2) baseada nos resultados da análise de Bhattacharya.
Os dados de entrada para o MODALPR são os resultados do programa
BHATTAC.
VBMODAL: Inteface para o programa VONBER.
Este programa é uma alternativa ao MODALPR. O utilizador decide quantas
coortes foram encontradas com a análise de Bhattacharya (parecido com a
análise de progressão modal), e o resultado é uma série de pares:
(L(1), t(1)), L(2), t(2)),......, (L(n), t(n))
onde L(i) = comprimento do peixe no i e t(i)=idade arbitrária do peixe no i.
Estes dados são, por sua vez, os dados de entrada para o programa “VONBER” que estima os parâmetros de crescimento.
GHBIRTH: Análise da data de eclosão. Esta análise está descrita na segunda parte da Secção 3.4.2, i. e. a estimação da data aproximada de eclosão através do gráfico de von Bertalanffy (cf. Tabela 3.4.2.4 e as Figs. 3.4.2.3 e 3.4.2.4). Os dados de entrada para o GHBIRTH são os resultados do programa MODALPR.
CCURVE: Análise de curva de capturas baseada em comprimentos. Esta análise está descrita na Secçães 4.4.5 e 6.5, i.e. a estimação de Z e a estimação da ogiva de selectividade da arte de pesca pela curva de capturas.
JONZAL: Método de Jones e van Zalinge. Estimação de Z como está descrito na Secção 4.4.6.
BHZWET: Equação de Beverton e Holt de Z e a análise de Powell-Wetherall. A estimação de Z, apresentada na Secção 4.5.2, e a estimação de L∞ e Z/K, apresentada na Secção 4.5.4.
LCOHOR: Análise de coortes de Jones baseada em comprimentos. Estimação do tamanho do manancial e da mortalidade por pesca, apresentada na Secção 5.3.
TBYR: Cálculo da captura em peso pelo modelo de Thompson e Bell baseado em idades. Este programa utiliza uma versão especial do modelo de Thompson e Bell para o cálculo da captura e tamanho do manancial, no caso da pesca a uma só espécie (cf. Secção 8.6). O programa tem em conta os números do manancial por classes de comprimento, calculado pelo LCOHOR, e concerte para grupos de idade, como está descrito em Secção 8.6. Este programa deve ser utilizado só para espécies de longa vida (5 anos ou mais), uma vez que a conversão das classes de comprimento para grupos de idade pode ser problemática no caso de espécies de vida curta.
MIXFISH: Modelo de Thompson e Bell baseado em comprimentos com a possibilidade de analisar o caso duma pescaria dirigida a várias espécies (só na versão IBM). A teoria envolvida está descrita nas Secções 8.7 e 10.4.1, sendo muito semelhante ao TBYR sem a conversão das classes de comprimentos para grupos de idade, e pode ser aplicada a espécies de vida longa ou curta. Apesar do MIXFISH ser útil para o caso duma pescaria dirigida a várias espécies, pode ser utilizado em pescarias dirigidas a uma só espécie.
SIMULL: Simulação Monte Carlo de amostras de frequências de comprimento (só na versão IBM). Este programa simula as amostras de frequências de comprimento pela simulação da vida de cada peixe individualmente, utilizando a técnica Monte Carlo.
SIMMIG: Simulação Monte Carlo de amostras de frequências de comprimento tomando em conta a migração (só na versão IBM). Este programa simula as amostras de frequências de comprimento da mesma forma que SIMULL, no entanto pode fazer em paralelo para várias áreas e toma em conta os movimentos dos peixes entre as áreas.
VONBER: Estimação dos parâmetros de von Bertalanffy. Este programa estima os parâmetros da equação de crescimento de von Bertalanffy (Eq. 3.1.0.1) através da análise de regressão não linear como descrito na Secção 3.1. Uma vez que os calculos são baseados em processos iteractivos que requerem muitos calculos, não foi apresentado nenhum exemplo neste manual.
Os dados de entrada para o VONBER é uma série de pares:
(L(1), t(1), (L(2), t(2)), ......, (L(n), t(n))
onde L(i) = comprimento do peixe no i e t(i) = idade do peixe no i.
O programa de VONBER determina os parâmetros, L∞, K e to que minimizam a soma dos quadrados dos desvios:
VBINPUT: Entrada de dados de comprimentos/idades. Semelhante ao programa LFIMPUT.
VBRESU: Resultados de VONBER.
VBGRAPH: Gráfico dos resultados de VONBER.
VBMERGE: Programa de fusão de ficheiros de comprimentos/idades.
BHYR: Análise da captura por recruta de Beverton e Holt. A estimação da captura/recruta e da biomassa/recruta (Capítulo 8)
PAULYM: Fórmula do M de Pauly (somente em versão IBM)
REGRES: Análise de regressão simples. Tal como descrito na secção 2.4 a 2.6, contém uma opção para a linearização.
REGRAPH: Gráficos da análise de regressão simples
O pacote COMPLEAT ELEFAN foi desenvolvido em torno do programa desenvolvido por Pauly e David (1981), ELEFAN (Electronic LEngth Frequency ANalysis), o qual aparece no pacote como ELEFAN I. Este programa foi detalhadamente descrito no Capítulo 3 e ambos têm passado por uma série de alterações. A última versão foi descrita por Gayanilo et al. (1988), e é constituido por menus de muito fácil utilização. Contém as seguintes rotinas e sub-rotinas:
UTILIDADES: Instalação periférica, rotina para copiar disquetes, instalação de porta de comunicação, rotina para formatar disquetes.
ELEFAN O: Entrada e edição de dados, rotina para imprimir, entrada da probabilidade de capturas e ficheiros de correcção, ajuste do intervalo da classe, rotina para apagar ficheiros, conjugação de amostras, junção de ficheiros, alisamento da amostra, estimação do peso da amostra.
ELEFAN I: Restruturação dos dados, ajuste de curvas a olho, procura automática, análise de superfície de resposta, rotina de resultados.
ELEFAN II: Ajuste da curva de selectividade, curva de captura e probabilidade de captura, padrão de recrutamento, gráfico de Powell/Wetherall, análise da captura relativa por recruta.
ELEFAN III: VPA baseada em idades, VPA baseada em comprimentos, VPA combinada, criação do ficheiro captura.
ELEFAN IV: Estimação do M.
ELEFAN V: Análide de superfície de resposta, gráfico de compatibilidades, análise do incremento de crescimento.
MPA: Método Bhattacharya, entrada de médias e desvios padrão, ligação das médias e coeficientes de variação do L∞.
A FAO e o Centro Internacional para a Gestão dos Recursos Vivos Aquáticos (ICLARM), em 1990, acordaram em desenvolver um novo pacote de programas, baseados em comprimentos, para a avaliação de mananciais, chamado FiSAT, FAO-ICLARM Stock Assessment Tools, (Ferramentas para a Avaliação de Mananciais da FAO-ICLARM). Para além duma integração de rotinas incorporadas no LFSA e COMPLEAT ELEFAN o FiSAT contém algumas rotinas novas, resolvendo assim, alguns problemas pendentes.
Tal como o COMPLEAT ELEFAN de fácil utilização o FiSAT, sempre que possível, apresenta os modelos e resultados sob a forma gráfica para uma fácil interpretação. As Figs. 15.3.1 e 15.3.2 mostram exemplos dos gráficos com os resultados.
Apesar do grande conjunto de rotinas para manipulação e/ou análise de dados de frequências de comprimento o FiSAT também trabalha com outros tipos de dados, como frequências de peso, dados de comprimentos á idade, dados de marcaçães, dados de selectividade (arrasto e rede de emalhar) e outros ficheiros. No entanto as análises que se podem executar com este tipo de dados são mais limitadas.
Outras características básicas que contribuem para a fácil utilização da interface FiSAT, são:
O programa é comparável a uma folha de cálculo, no qual o ficheiro pode ser alcançado apenas com uma tecla.
Rotinas agrupadas distintamente, para um fácil acesso através dos menus.
Mensagens de ajuda, descrição do modelo e principais pressupostos aparecem em janelas
Suporta várias configurações do monitor (CGA, EGA, VGA, HERCULES, etc.).
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| Fig. 15.3.1 Representação dos resultados da VPA baseada em comprimentos | Fig. 15.3.2 Diagrama de isopletas das capturas do modelo de B - H |
Fig. 15.3.3 Identificação do sistema do pacote FiSAT
O esquema geral do pacote FiSAT é dado na Fig. 15.3.3. Existem 4 grupos de rotinas principais:
FICHEIROS, ACESSO, AJUDA e UTILIDADES
ACESSO contém o programa de avaliação de mananciais e os outros 3 grupos contêm as rotinas preliminares (FICHEIROS) e de ajuda (AJUDA E UTILIDADES).
Contém, igualmente, alguns modelos/métodos que não foram incorporados neste manual, excepto na lista de referências (ver Appeldroorn, 1987; Ault e Ehrhardt, 1991; Fabens, 1965; Munro, 1982; Pauly et al.; 1992, e Shepherd, 1987). No entanto, o manual produzido para os utilizadores do FiSAT, contém as explicações necessárias.
O Pacote ANACO contém dois conjuntos de programas relaçionados com a VPA e tem a ajuda dum manual (editado em Inglês, Francês e Espanhol, Mesnil, 1989)
SIMUCO foi realizado principalmente como ferramenta para explorar os mecanismos e propriedades da análise sequencial dos dados de capturas á idade. Inclui também a possibilidade de se executar análises com dados de um só ano, com a possibilidade de corrigir para condições de equilíbrio e dá uma introdução à análise de sensibilidades.
VBBAS-COHORT-VPUTIL faz a avaliação de mananciais usando séries temporais de dados de captura á idade, como é pratica comum em muitos grupos de trabalho e comissões das pescarias. VPBAS e VPUTIL são utilizados na construção e actualização da base de dados e COHORT para os cálculos da VPA.
Consiste em quatro programas, ANALEN, ANAJON, SENJON e MONOJO, usados em análises de capturas por comprimentos e executa simulações para pescarias com multi artes, com análises de sensibilidade. Existe um manual em Francês (Chevaillier e Laurec, 1990)
ANALEN executa a análise de coortes de Jones baseada em comprimentos.
ANAJON calcula as capturas em peso por recruta e a biomassa desovante por recruta, para diferentes níveis de exploração. Realiza tanbém projecções das capturas a curto e a longo prazo.
SENJON é utilizado para análises de sensibilidade aos resultados.
MONOJO é utilizado para avaliar as interacções técnicas entre as diferentes artes.
BEAM 1 e BEAM 2 são programas de modelação bio-ecomómica simples para pescarias industrial e artesanal de camarões, baseados no modelo de capturas por recruta de Thompson e Bell e com uma entrada de dados micro-económicos para um modelo. Equanto que o BEAM 1 simula resultados para grupos de idades, o BEAM 2 utiliza categorias comerciais padronizadas. O manual é a primeiro de uma série de informações informatizadas da FAO (Pescarias) (Coppola et al., 1992).
Este programa dá uma análise mais poderosa das pescarias complexas que o BEAM 1 e BEAM 2. É um modelo estocástico que pode trabalhar com 4 espécies (ou com os dois sexos de duas espécies) e muitas frotas a operar sequencialmente ou simultameamente. O manual foi editado em Francês por Cochet e Gilly, 1990
Este programa de Sparre e William (1992), é o mais geral e o mais complicado da série de programas BEAM. Permite uma simulação mais realística das pescarias e necessita de muitos mais dados que os outros programas.
Todos os programas BEAM podem ser usados em qualquer PC IBM ou 100% compatível, com necessidades mínimas dos sistemas operativos PC-DOS e MS-DOS.
Desenvolvido por Strömme (1992) para processar dados de cruzeiros de R/V DR. FRIDTJOF NANSEN, em particular para o método da área varrida.
NAN-SIS é um sistema de informação para cruzeiros para registar, processar e analisar os dados de cruzeiros de arrasto de investigação científica (dados de capturas e frequências de comprimentos). Fornece subconjuntos de dados seleccionados do número da estação de arrasto, espécie, género, famílias, ou grupos de espécies definidos. Os principais resultados são:
Tabelas de capturas, taxas de capturas médias e variâncias para os subconjuntos definidos pelo utilizador.
Cálculo da área varrida (densidade média por milha náutica quadrada).
NAN-SIS contém rotinas para transferir os dados acessíveis para outros programas, tal como STATGRAPHICS, LFSA, COMPLEAT ELEFAN e FiSAT. Uma vez que em águas tropicais existe um número muito grande de espécies, é necessário a utilização dum sistema de códigos para trabalhar, que é convertido para o nome científico ou nome vulgar na impressão final.
Uma versão ampliada do NAN-SIS inclui programas para registar, processar e analisar dados acústicos. Estes programas, contudo, são específicos para certos modelos de equipamentos acústicos e não são contemplados pelo manual.
CLIMPROD (Fréon et al., 1992) combina variáveis ambientais com modelos de produção geral. Requer séries de dados anuais de capturas e esforço dum só manancial, e séries de dados anuais (ou sazonais) de uma variável ambiental que influencie a abundância ou capturabilidade do manancial. O conjunto de dados deve cobrir pelo menos 12 anos. O resultado de ajustar o modelo apropriado aos dados pode explicar como o ambiente e o esforço de pesca determinam as capturas num período considerado. Com estimações do esforço e de diferentes factores ambientais para os próximos dois anos pode-se prever novas capturas.
CLIMPROD pode também ser utilizado para ajustar o modelo convencional de produção geral (linear, exponencial, geral) sem dados ambientais, ou para ajustar a relação entre o ambiente e a produção sem pescarias.
