El taller tuvo muy en cuenta que muchas de estas recomendaciones tendían significativas consecuencias presupuestarias. Se reconoció que ciertas partes del proceso de proveer asesoramiento científico a Codex y a los países miembro podría ser realizado de una manera más costo-efectiva. Sin embargo, se consideró que las mejoras necesarias en la cantidad, calidad, oportunidad y transparencia de la provisión del asesoramiento científico requeriría un incremento considerable y estructural en los recursos financieros y humanos. Debido a las limitaciones temporales, el taller no pudo elaborar una estimación de los costos de implementar sus recomendaciones. Se acordó solicitar a FAO y a la OMS que efectúen esas estimaciones como parte de los próximos pasos del proceso consultivo.
Se puso de resalto que no deberían verse en forma aislada los fondos suficientes y sustentables para los programas de asesoramiento científico sino en relación al financiamiento de Codex y de las actividades relacionadas con éste, como el Fondo de Fideicomiso de Codex para una mayor participación de los países en vías de desarrollo en el trabajo del Codex. Estas actividades están interrelacionadas, hasta un cierto punto, y la financiación para dichos diferentes aspectos puede provenir de las mismas fuentes de financiamiento.
