Con diversas investigaciones, expertos del doctorado de la Universidad Autónoma Metropolitana (UAM) en México y el Proyecto Buena Milpa de Guatemala llevan a cabo estudios de investigación en diversas comunidades de Todos Santos con el objetivo principal de generar el rediseño de los sistemas agrícolas a partir de procesos participativos o de colaboración con los diferentes grupos de agricultores utilizando tres distintas escalas: intervención principal con la parcela agrícola, análisis y caracterización de las unidades de producción familiar; y realización de recomendaciones sobre el uso de la tierra y su entorno (paisaje).