Рециркуляция позволяет производить сельскохозяйственную продукцию с меньшими экономическими и экологическими издержками.

Отходы – понятие антропогенное: в естественных экосистемах отходов не бывает. Имитируя природные экосистемы, агроэкологические методы хозяйствования поддерживают биологические процессы, способствующие рециркуляции питательных веществ, биомассы и воды в производственных системах, что позволяет повысить эффективность использования ресурсов и свести к минимуму отходы и загрязнение окружающей среды.

Рециркуляция может происходить как на уровне фермерских хозяйств, так и в рамках ландшафта за счет диверсификации и обеспечения синергии различных компонентов системы и видов деятельности. Например, если в агролесоводческих системах есть деревья с глубокой корневой системой, они могут использовать питательные вещества, не усвоенные корнями однолетних культур. Функционирование систем, сочетающих растениеводство с животноводством, способствует рециркуляции органических веществ за счет использования навоза для компостирования или непосредственно в качестве удобрения, а растительных остатков и побочных продуктов – в качестве корма для скота. На круговорот питательных веществ приходится 51 процент экономической ценности всех экосистемных услуг, не относящихся к категории обеспечивающих, и интеграция животноводства играет в этом большую роль. То же касается и рыбо-рисоводческих систем, в которых водные животные помогают удобрять рис и бороться с вредителями, снижая потребность во внешних удобрениях и пестицидах.

Рециркуляция обеспечивает многочисленные преимущества за счет замкнутости циклов и сокращения количества отходов. Благодаря этому снижается зависимость от внешних ресурсов, повышается самостоятельность производителей и уменьшается их уязвимость к рыночным и климатическим потрясениям. Рециркуляция органических веществ и побочных продуктов открывает большие возможности для агроэкологических инноваций.