La formation générale en Agroécologie d’AGROTOPIA est holistique. La formation privilégie l’acquisition de connaissances à partir de la pratique par l’observation de situation réelles, des travaux pratiques, la participation à des travaux agricoles, la conception et le développement de projets, en mobilisant des notions théoriques en fonction des besoins des participants. Les connaissances y sont acquises de manière itérative.

Chaque participant décrit son projet personnel dès la phase d’inscription. Ce projet personnel est central tout au long de la formation. Il évolue en fonction des connaissances acquises. Cette démarche est à l’opposé d’une formation linéaire, par matière, qui aboutit éventuellement à concevoir un projet. Chaque participant perçoit donc à tout moment la raison de sa participation à la formation puisque celle-ci est intimement liée à son projet individuel.