厄尔尼诺通常使非洲之角 10 月至 12 月的降雨量高于平均水平，可能引发洪水和山体滑坡，影响农业并增加疾病风险。受其影响，7 月至 9 月，东非西部地区（埃塞俄比亚西部、苏丹、南苏丹、乌干达、肯尼亚西部）的降雨量低于平均水平。在南部非洲的大部分地区，由于厄尔尼诺现象，过去几年 11 月至次年3月降雨量减少，而这段时间正是主要种植季。这可能会影响作物收成和牲畜生产率，使国内粮食供应面临挑战和粮食极其不安全的国家形势雪上加霜。在西非和萨赫勒地区，厄尔尼诺使7月至 9 月的降水量低于平均水平，这段时间正是主要种植季。这可能使国内粮食供应面临挑战的国家形势进一步恶化，在全球粮价高企的情况下日益依赖进口。

在南美洲北部，厄尔尼诺造成 6月至次年3月降雨量低于平均水平。在中美洲，尤其是干旱走廊，厄尔尼诺造成6月至12月的干旱，可能影响主要种植季的末期以及9月至12月主要种植季的作物长势。主要种植季是指玉米的主要种植季，也泛指该区域多数国家的农业季。