Таджикистан сотрудничает с ФАО со времени вступления страны в Организацию в 1995 году. Первоначально помощь ФАО заключалась в реализации краткосрочных чрезвычайных мер реагирования в связи со вспышками саранчи, а также в оказании поддержки стране в период ее перехода к мирной жизни после гражданской войны. Впоследствии акцент сотрудничества сместился на проведение мероприятий по восстановлению и развитию в целях создания устойчивого сельскохозяйственного сектора и обеспечения продовольственной и пищевой безопасности.