秘书处
全球根除小反刍兽疫计划（PPR-GEP）秘书处设在联合国粮食及农业组织总部，经由粮农组织和国际兽疫局共同商定的两名人员组成，负责将全球控制和根除策略转变为全球根除计划工作的总体管理及其实施、评估、完善和报告事宜。
秘书处向逐步防控跨境动物疫病全球框架（GF-TAD，简称“全球跨境动物疫病防控框架”）管理委员会报告，以与其他逐步防控跨境动物疫病全球框架倡议和指南进行协调。协调情况会报告给全球跨境动物疫病防控框架指导委员会的联合主席。
全球根除小反刍兽疫计划秘书处的任务包括制定年度和五年计划，以供全球跨境动物疫病防控框架全球指导委员会批准；制定活动日程并寻求批准，以及就实施获批准的年度计划和年度日程活动向地区全球跨境动物疫病防控框架秘书处提供指导。
全球根除小反刍兽疫计划秘书处还将为促进和推动在全球、区域和国家层面实施全球根除小反刍兽疫计划策略进行协调；就全球根除计划和倡导工作中取得的进展进行沟通，即代表粮农组织/国际兽疫局出席国际、区域和国家会议，确定可互补的合作伙伴/领域，以及在必要时就适当的协作行动提出建议。
秘书处还负责该计划的总体管理和实施事宜，就小反刍兽疫、小反刍动物的生产与卫生、应用诊断和流行病学主题以及疫苗生产与国际兽疫局和粮农组织咨询中心联络，以支持全球根除小反刍兽疫计划的实施。