وتعقد الهيئات الإقليمية اجتماعاتها كل سنتين وتستفيد من مخصصات خاصة بها في موازنة المنظمة. كما تتولى خدمتها أمانة فنية تتحمل المسؤولية عن جميع عملياتها.

• هيئة الزراعة والأراضي واستخدام المياه (ALAWUC) تقدم هيئة الزراعة والأراضي واستخدام المياه منتدى/منبراً تستطيع البلدان الأعضاء من خلاله تبادل المعلومات والخبرات بشأن مسائل الزراعة والأراضي واستخدام المياه ومصادر القلق المهمة فيها. وتقوم الهيئة بتشجيع التعاون الإقليمي وتحت الإقليمي للتغلب على المشاكل التي تعترض هذه البلدان في مجال إدارة موارد المياه والاستخدام المستدام للأراضي وصون موارد الأراضي والمياه في المنطقة.
• الهيئة الإقليمية لمصايد الأسماك  (RECOFI) تتمثل مهمة الهيئة الإقليمية لمصايد الأسماك في تعزيز التنمية والحفظ والإدارة الرشيدة والاستخدام الأفضل للموارد البحرية الحية، فضلاً عن التنمية المستدامة للاستزراع المائي في الخليج وبحر عمان.
• هيئة الغابات والمراعي في الشرق الأدنى (NEFRC) تتمثل مهمة هيئة الغابات والمراعي في الشرق الأدنى في تقديم منتدى/منبر للتباحث في السياسات والمسائل التقنية تستطيع بلدان الشرق الأدنى فيه تدارس ومعالجة المسائل المتصلة بالغابات على أساس إقليمي، كما تقدم الهيئة المشورة في مجال رسم سياسات الغابات واستعراضات حالتها، وتنسيق تنفيذ هذه السياسات على الصعيد الإقليمي.
• هيئة مكافحة الجراد الصحراوي في المنطقة الوسطى (CRC) يتمثل الدور الرئيسي للهيئة في تعزيز التعاون والتنسيق بين الدول الأعضاء في المنطقة على الصعيد المحلي والإقليمي والدولي، مع إيلاء اهتمام خاص لتنمية القدرات المتعلقة برصد ومكافحة الجراد الصحراوي.