A Agência Brasileira de Cooperação do Ministério das Relações Exteriores (ABC/MRE) é a instituição responsável pela coordenação, negociação, aprovação e acompanhamento das atividades previstas no âmbito do Programa de Cooperação Sul-Sul Brasil-FAO, do qual participam diferentes ministérios parceiros. A Agência, que conta com quase 40 anos de experiência em cooperação internacional, coordena o intercâmbio de conhecimentos, habilidades e experiências desenvolvidos por instituições e organizações brasileiras, com foco no desenvolvimento de capacidades e na aprendizagem mútua entre os atores envolvidos.
Na perspectiva do direito humano à alimentação adequada nas escolas, a cooperação em alimentação escolar é realizada por meio da parceria com o Fundo Nacional de Desenvolvimento da Educação (FNDE). A governança responsável da posse da terra é promovida em parceria com o Instituto Nacional de Colonização e Reforma Agrária (Incra). Em uma parceria histórica com o Ministério do Desenvolvimento Agrário e Agricultura Familiar (MDA), promove-se o fortalecimento da agricultura familiar por meio da construção, baseada no diálogo, de importantes políticas públicas. Com apoio financeiro do Instituto Brasileiro do Algodão (IBA), a cadeia de valor do algodão tem sido fortalecida nos países da região.
Junto ao Ministério do Desenvolvimento e Assistência Social, Família e Combate à Fome (MDS), o Programa de Cooperação concentra esforços na promoção de sistemas agroalimentares urbanos eficientes, inclusivos, sustentáveis e resilientes, com especial atenção às populações em situação de vulnerabilidade. A parceria com a Companhia Nacional de Abastecimento (CONAB) é orientada ao fortalecimento dos sistemas públicos de abastecimento de alimentos, uma ferramenta fundamental para garantir o fornecimento eficiente e acessível de alimentos nas cidades.