No âmbito do Programa de Cooperação Internacional Brasil-FAO, a Agência Brasileira de Cooperação do Ministério das Relações Exteriores do Brasil (ABC/MRE) é a instituição responsável pela coordenação e acompanhamento das atividades planejadas. 

O Programa é executado conjuntamente pelo governo do Brasil, por meio da ABC, e pelo Escritório Regional da FAO, com sede em Santiago do Chile, além das seguintes instituições da República Federativa do Brasil: Fundo Nacional de Desenvolvimento Educacional / Ministério da Educação (FNDE / MEC), Ministério da Cidadania, Ministério do Meio Ambiente (MMA), Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (Mapa) e Instituto Nacional de Colonização e Reforma Agrária (Incra). 

Essas instituições parceiras apoiam a implementação dos projetos em andamento nas áreas de: Alimentação Escolar; Fortalecimento do diálogo entre a FAO, os governos e a sociedade civil; Fortalecimento Institucional da Pesca e Aquicultura; Segurança Alimentar e Nutricional; Políticas Agroambientais; Fortalecimento do Setor de Algodão; Cooperação Humanitária; América Latina e Caribe sem Fome; Governança responsável de terras e compras públicas da Agricultura Familiar.