En el CATIE tenemos como objetivo promover una ruta propicia para lograr el Desarrollo Verde Inclusivo, mediante la construcción del capital humano, el fortalecimiento institucional para la investigación, el desarrollo y la proyección externa. Para esto, la institución se fundamenta en la siguiente misión, visión y valores:
Promovemos el Desarrollo Verde Inclusivo, a través del conocimiento científico y la formación de nuevos líderes, gestionando los ecosistemas, paisajes y sistemas alimentarios, que con su permanencia favorecen al bienestar sostenible de las poblaciones en el trópico de América Latina y el Caribe.
El CATIE posicionado como referente en investigación, educación e innovación al servicio de los pueblos del trópico de América Latina y el Caribe, buscando el equilibrio entre el uso y la protección de los paisajes, ecosistemas y sistemas de producción que forman parte del bienestar sostenible y la salud de la gente, así como de todas las formas de vida que hacen parte del planeta.